[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 8، شماره 3 - ( 9-1400 ) ::
جلد 8 شماره 3 صفحات 281-270 برگشت به فهرست نسخه ها
استخراج ویژگی چندمتغیره برای پیش‌بینی ماتریس بیان ژنی آینده
پریناز اسکندریان ، جمشید باقرزاده محاسفی ، حبیب اله پیرنژاد ، زهرا نیازخانی
دکتری مهندسی نرم‌افزار، دانشیار، دانشکده مهندسی برق و کامپیوتر، دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران
چکیده:   (409 مشاهده)
مقدمه: ویژگی‌های یک سلول را می‌توان با بررسی ماتریس بیان ژنی مربوط به آن سلول تعیین کرد. اگر بتوان ماتریس‌های بیان ژنی مربوط به سلول‌های فرزند آینده را پیش‌بینی کرد، در حقیقت ویژگی‌های سلول‌های آینده پیش‌بینی شده‌اند. هدف مطالعه حاضر، طراحی یک شبکه عصبی مصنوعی برای پیش‌بینی ماتریس‌های بیان ژنی برای سلول‌های فرزندی است که از تقسیم/تمایز سلول‌های بنیادی هماتوپویتیک در آینده به دست خواهند آمد.
روش: شبکه عصبی طراحی‌‌شده ماتریس بیان ژنی یک سلول بنیادی هماتوپویتیک والد را به عنوان ورودی می‌گیرد و ماتریس‌های بیان ژنی مربوط به سلول‌های فرزند آینده آن را تولید می‌کند. یک کدگذار زمانی برای کدگذاری سری زمانی اصلی و یک کدگذار مکانی برای کدگذاری سری‌های زمانی ثانویه پیشنهاد می‌شود.
نتایج: برای آن که پیش‌بینی قابل پذیرشی انجام شود، باید ماتریس­های بیان ژنی مربوط به دست­کم چهار مرحله اولیه از تقسیم/تمایز مشخص باشند. شبکه عصبی طراحی­شده از نظر خطای پیش‌بینی و تعداد مراحل تقسیم/تمایز که به درستی پیش‌بینی شده باشند، نسبت به شبکه­های عصبی موجود بهتر عمل می‌کند. طرح پیشنهادی این مطالعه می­تواند پیش‌بینی را برای صدها مرحله از تقسیم/تمایز سلولی انجام دهد. خطای طرح پیشنهادی برای پیش­بینی 1، 4، 16، 64 و 128 مرحله از تقسیم/تمایز به ترتیب برابر با 3/04، 3/76، 5/5، 7/83، و 11/06 درصد بوده است.
نتیجه‌گیری: با داشتن ماتریس بیان ژنی مربوط به یک سلول هما‌توپویتیک والد می‌توان ماتریس‌های بیان ژنی مربوط به فرزندان آن را تا صدها مرحله از تقسیم/تمایز پیش‌بینی کرده و در صورت لزوم، به موقع چاره‌ای برای روبه‌رو شدن با مشکلات ژنتیکی آینده اندیشید.
واژه‌های کلیدی: سلول بنیادی هماتوپویتیک، شبکه عصبی، سری زمانی چندمتغیره، ماتریس بیان ژنی، پیش‌بینی
متن کامل [PDF 1042 kb]   (114 دریافت)    
نوع مطالعه: پژوهشي اصیل | موضوع مقاله: هوش مصنوعی در حوزه سلامت
دریافت: 1400/4/15 | پذیرش: 1400/9/24
فایل صوتی [MP3 1015 KB]  (8 دریافت)
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Eskandarian P, Bagherzadeh Mohasefi J, Pirnejad H, Niazkhani Z. Multivariate Feature Extraction for Prediction of Future Gene Expression Profile. Journal of Health and Biomedical Informatics. 2021; 8 (3) :270-281
URL: http://jhbmi.ir/article-1-610-fa.html

اسکندریان پریناز، باقرزاده محاسفی جمشید، پیرنژاد حبیب اله، نیازخانی زهرا. استخراج ویژگی چندمتغیره برای پیش‌بینی ماتریس بیان ژنی آینده. مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی. 1400; 8 (3) :281-270

URL: http://jhbmi.ir/article-1-610-fa.html



بازنشر اطلاعات
Creative Commons License این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است.
دوره 8، شماره 3 - ( 9-1400 ) برگشت به فهرست نسخه ها
مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی Journal of Health and Biomedical Informatics
Persian site map - English site map - Created in 0.04 seconds with 29 queries by YEKTAWEB 4410