مقدمه: یکی از مهم‌ترین دلایل مرگ‌و‌میر در بین بیماران سرطانی متاستاز است. اخیراً نشان داده شده است که گروه خاصی از miRNAها(microRNA) که metastamir نامیده می‌شوند دارای اثر متاستاتیکی هستند. miR-۱۲۶ ارتباط مشخصی با متاستاز سرطان روده به کبد دارد. همچنین در متاستاز سرطان سینه miR-۱۰b بیان بیش از حد پیدا می‌کند؛ بنابراین کاهش سطح بیان این miRNAها می‌تواند نقش مهمی در کاهش احتمال متاستاز داشته باشد. در این تحقیق تکنیک CRISPR-C۲c۲(Cas۱۳a) به منظور هدفگیری پیش‌سازهای miRNA جهت کاهش اثر متاستاتیکی آن‌ها مورد بررسی قرار گرفت.
روش: پژوهش با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیک و بیوانفورماتیک ساختاری انجام شد. ساختار آنزیم C۲c۲ از پایگاه داده RCSB و توالی‌های miRNA و پیش‌سازهای آن‌ها از پایگاه‌های داده MirBase و Mirnamap تهیه شدند. با استفاده از سیستم برخط CRISPR-RT، crRNAهای هدف گیرنده توالی مورد نظر طراحی و از نظر اختصاصیت مورد بررسی و ارزیابی قرار گرفتند. ساختار سه بعدی crRNAهای طراحی شده با استفاده از نرم‌افزار RNAbuider۲,۸.۲ شبیهسازی و به منظور بررسی نحوه اتصال و سطح انرژی اتصالی crRNA با آنزیم C۲c۲(Cas۱۳a) از سرور Hdock استفاده شد.
نتایج:crRNA طراحی شده با هدف mir-۱۲۶ مشابهت ساختاری بالا با وضعیت مشاهده شده در طبیعت نشان داده و جهتگیری مناسب حاصل شد. در مورد crRNA طراحی شده به منظور هدفگیری mir-۱۰b با وجود اختصاصیت بالا جهتگیری درستی ایجاد نشد.
نتیجهگیری: بررسی توالی محور crRNAهای طراحی شده برای ویرایش در سطح RNA کافی نیست و توصیه میشود در کنار بررسیهای برپایه اختصاصیت، شبیهسازی و داکینگ مولکولی به منظور دقت هر چه بیشتر انجام شود.
