<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Health and Biomedical Informatics</title>
<title_fa>مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی</title_fa>
<short_title>jhbmi</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://jhbmi.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2423-3870</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2423-3498</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi></journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1396</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2018</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>4</volume>
<number>4</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی گونه‌های نوکاردیا با استفاده از ژن‌های 16S rRNA، hsp65 و gyrB</title_fa>
	<title>Phylogenetic Analysis of Nocardia spp. using 16S rRNA, hsp65 and gyrB Genes</title>
	<subject_fa>تخصصي</subject_fa>
	<subject>Special</subject>
	<content_type_fa>پژوهشي اصیل</content_type_fa>
	<content_type>Original Article</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;مقدمه:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; نوکاردیا یکی از مهم&#8204;ترین گروه از اکتینومایست&#8204;های هوازی است که در خاک زندگی می&#8204;کند و قادر است به وسیله تنفس و تلقیح تروماتیک به بدن انسان وارد شود و عفونت نوکاردیوزیس را به وجود آورد. روش&#8204;های مولکولی یکی از بهترین روش&#8204;های سریع و دقیق برای شناسایی و افتراق این گروه از باکتری&#8204;ها می&#8204;باشد. هدف از این مطالعه ارزیابی سه ژن خانه&#8204;دار در تشخیص و تفریق مهم&#8204;ترین گونه&#8204;های نوکاردیا بود.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;روش:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; در این مطالعه مقطعی، ابتدا توالی ژن&#8204;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;16S rRNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;gyrB&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;hsp65&lt;/span&gt; برای ده گونه نوکاریا از بانک ژنی دریافت شد. سپس توالی ها به کمک نرم&#8204;افزار&#8204;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;AL16S&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;jPhydit&lt;/span&gt; هم ردیف شدند، سپس اطلاعات به برنامه &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;MEGA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt; منتقل شد و در نهایت درخت فیلوژنتیک براساس هر یک از ژن&#8204;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;16S rRNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;gyrB&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;hsp65&lt;/span&gt; به طور جداگانه رسم شد.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;نتایج&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt;&lt;strong&gt;:&lt;/strong&gt; تجزیه&#8204;و&#8204;تحلیل درخت فیلوژنتیک حاصل از ژن&#8204;های &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;16S rRNA&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;، &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;gyrB&lt;/span&gt; و &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;hsp65&lt;/span&gt; نشان داد که همه این ژن&#8204;ها گونه&#8204;های نوکاردیا را تشخیص دادند. همچنین ژن &lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;gyrB&lt;/span&gt; بهترین گزینه برای ترسیم روابط فیلوژنتیک گونه نوکاردیا می&#8204;باشد.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;نتیجه&#8204;گیری:&lt;/strong&gt;: براساس پژوهش حاضر، برای شناسایی و افتراق صحیح گونه&#8204;های نوکاردیا می&#8204;بایست چند ژن خانه&#8204;دار به طور همزمان مطالعه شود.&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;/div&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Introduction:&lt;/strong&gt; Nocardia is one of the most important aerobic actinomycetes that lives in soil and can enter the human body by inhalation and traumatic inoculation and causes Nocardiosis. Molecular methods are one of the best methods for rapid and accurate identification and differentiation of species of this group of bacteria. The purpose of this study was evaluation of three housekeeping genes in identification and differentiation of most important species of Nocardia.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Methods:&lt;/strong&gt; In this study cross-sectional, first, gene sequences of 16S rRNA, gyrB and hsp65 for ten species of Nocardia were obtained from Genebank (NCBI). Then, those sequences were transferred to MEGA 5.0. Finally, phylogenetic trees based on each of 16S rRNA, gyrB and hsp65 genes were drawn.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; Phylogenetic trees analysis based on 16S rRNA, gyrB and hsp65 gene sequences indicated that all of these genes could identify and differentiate Nocardia species. Also, it was found that gyrB gene is the best option for drawing the phylogenetic relationships of Nocardia species.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Conclusion&lt;/strong&gt;: According to this research, for accurate identification of Nocardia species, several housekeeping genes should be investigated simultaneously.&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;/div&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>نوکاردیا, تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک,16S rRNA  



</keyword_fa>
	<keyword>Nocardia, Phylogenetic analysis, 16S rRNA</keyword>
	<start_page>305</start_page>
	<end_page>312</end_page>
	<web_url>http://jhbmi.ir/browse.php?a_code=A-10-271-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Masoud</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Keikha</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>مسعود</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>کیخا</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>masoud.keykha90@gmail.com</email>
	<code>10031947532846003687</code>
	<orcid>10031947532846003687</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>M.Sc. student in Microbiology, Isfahan University of Medical Sciences, Isfahan, Iran.</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشجوی کارشناسی ارشد میکروب شناسی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی اصفهان، اصفهان، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
