<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<journal>
<title>Journal of Health and Biomedical Informatics</title>
<title_fa>مجله انفورماتیک سلامت و زیست پزشکی</title_fa>
<short_title>jhbmi</short_title>
<subject>Medical Sciences</subject>
<web_url>http://jhbmi.ir</web_url>
<journal_hbi_system_id>1</journal_hbi_system_id>
<journal_hbi_system_user>admin</journal_hbi_system_user>
<journal_id_issn>2423-3870</journal_id_issn>
<journal_id_issn_online>2423-3498</journal_id_issn_online>
<journal_id_pii></journal_id_pii>
<journal_id_doi></journal_id_doi>
<journal_id_iranmedex></journal_id_iranmedex>
<journal_id_magiran></journal_id_magiran>
<journal_id_sid></journal_id_sid>
<journal_id_nlai></journal_id_nlai>
<journal_id_science></journal_id_science>
<language>fa</language>
<pubdate>
	<type>jalali</type>
	<year>1396</year>
	<month>12</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<pubdate>
	<type>gregorian</type>
	<year>2018</year>
	<month>3</month>
	<day>1</day>
</pubdate>
<volume>4</volume>
<number>4</number>
<publish_type>online</publish_type>
<publish_edition>1</publish_edition>
<article_type>fulltext</article_type>
<articleset>
	<article>


	<language>fa</language>
	<article_id_doi></article_id_doi>
	<title_fa>کاربرد و نقش هستان‌شناسی در نظام‌های بازیابی اطلاعات زیست‌پزشکی </title_fa>
	<title>Application and Role of Ontologies in Biomedical Information Retrieval Systems</title>
	<subject_fa>سیستمهای بازیابی اطلاعات و سیستمهای پردازش زبان طبیعی</subject_fa>
	<subject>Information Retrieval &amp; Natural Language Processing systems</subject>
	<content_type_fa>مقاله مروری تشریحی</content_type_fa>
	<content_type>Narrative review articles</content_type>
	<abstract_fa>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-family:tahoma;&quot;&gt;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;مقدمه:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; هستان&#8204;شناسی&#8204;ها کیفیت بازیابی اطلاعات را افزایش می&#8204;دهند؛ بنابراین شناخت بیشتر فرآیند ساخت هستان&#8204;شناسی&#8204;ها و کاربرد آن&#8204;ها در نظام&#8204;های بازیابی اهمیت می&#8204;یابد. هدف این مطالعه بررسی کاربردها و روش ساخت هستان&#8204;شناسی&#8204;هایی است که در نظام&#8204;های بازیابی اطلاعات زیست&#8204;پزشکی مبتنی بر هستان&#8204;شناسی به کار رفته&#8204;اند.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;روش:&lt;/span&gt;&lt;/strong&gt; این پژوهش مروری از نظر روش مطالعه کتابخانه&#8204;ای با رویکرد تحلیلی است. بازیابی اطلاعات مرتبط با موضوع پژوهش از پایگاه&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&#8204;&lt;/span&gt;های اطلاعاتی پاب&#8204;مد، اسکوپوس و وب&#8204;آوساینس بدون محدودیت زمانی با استفاده از کلیدواژه&#8204;های &amp;quot;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;Ontology-based biomedical Information Retrieval&amp;quot;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;&amp;quot; Information Retrieval&amp;quot;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;،&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;&amp;quot;Biomedical Information Retrieval&amp;quot;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;&amp;quot;Ontology engineering&amp;quot;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;&amp;quot;Ontology construction&amp;quot;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;، &lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;&amp;quot;Biomedical Ontology&amp;quot;&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;&amp;nbsp; و &amp;quot;&lt;/span&gt;&lt;span dir=&quot;LTR&quot;&gt;&lt;span style=&quot;font-size:11.0pt;&quot;&gt;Ontology building&lt;/span&gt;&lt;/span&gt;&amp;quot;انجام شد. 5 مقاله که به معرفی یک نظام بازیابی اطلاعات زیست&#8204;پزشکی می&#8204;پرداختند و در ذخیره یا بازیابی اطلاعات آن&#8204;ها از هستان&#8204;شناسی استفاده می&#8204;شد، بررسی شدند.&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;strong&gt;&lt;span style=&quot;color:black;&quot;&gt;نتایج&lt;/span&gt;:&lt;/strong&gt; مطالعات در زمینه بازیابی اطلاعات زیست&#8204;پزشکی مبتنی بر هستان&#8204;شناسی که از سال 2004 آغاز شده به یک کشور محدود نمی&#8204;شوند. به طور کلی هدف استفاده از هستان شناسی&#8204;ها استفاده از فراداده&#8204;های معنایی است. اکثر مطالعات سعی دارند هستان شناسی&#8204;های خاص خود را تولید کنند؛ اما استفاده&#8204; مجدد از هستان&#8204;شناسی&#8204;های پیشین یک الویت است. مواد اولیه تولید هستان&#8204;شناسی متون مرتبط با حیطه موضوعی است. هستان&#8204;شناسی&#8204;های مورد بررسی به صورت متمرکز تولید شده&#8204;اند و از رویکردهای گروهی غیرمتمرکز استفاده نشده است.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;نتیجه&#8204;گیری:&lt;/strong&gt; هدف اصلی نظام&#8204;ها برای به کارگیری هستان&#8204;شناسی&#8204;ها استفاده از آن&#8204;ها برای تولید فراداده&#8204;های معنایی برای کمک برای استدلال ماشینی است.&lt;/span&gt;&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;/div&gt;
</abstract_fa>
	<abstract>&lt;div style=&quot;text-align: justify;&quot;&gt;&lt;strong&gt;Introduction:&lt;/strong&gt; Ontologies improve the quality of information retrieval (IR). Therefore, it is important to better know the process of ontology engineering and their application in IR. The aim of this research was to identify the engineering methods of ontologies and also their application in biomedical IR.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Method:&lt;/strong&gt; This review was done through library research method with an analytical approach. Required information for the review was retrieved from Pubmed, Scopus and Web of Science using keywords: &amp;quot;Ontology-based biomedical Information Retrieval&amp;quot;, &amp;quot;Information Retrieval&amp;quot;, &amp;quot;Biomedical Information Retrieval&amp;quot;,&amp;nbsp; &amp;quot;Ontology engineering&amp;quot;, &amp;quot;Ontology construction&amp;quot;,&amp;nbsp; &amp;quot;Biomedical Ontology&amp;quot; and &amp;quot;Ontology building&amp;quot; without time limit. Five articles addressing an ontology-based biomedical IR system were reviewed.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Results:&lt;/strong&gt; Studies on ontology based biomedical IR, started in 2004, are not limited to a single country. In general, ontologies are used to manage the semantic metadata. Although most IRs try to develop their own ontologies, reuse of earlier ontologies is a priority. The material for developing ontologies is taken from the literature in the domain. The studied ontologies have been produced by centralized approaches and decentralized approaches and different groups have not been used.&lt;br&gt;
&lt;strong&gt;Conclusion&lt;/strong&gt;: The main purpose of systems for applying ontologies is using them to develop semantic metadata for helping machine reasoning.&lt;br&gt;
&amp;nbsp;&lt;/div&gt;
</abstract>
	<keyword_fa>ذخیره و بازیابی اطلاعات, هستان‌شناسی‌های زیستی, نظام‌های اطلاعاتی</keyword_fa>
	<keyword>Information Storage and Retrieval, Biological Ontologies, Information Systems</keyword>
	<start_page>327</start_page>
	<end_page>340</end_page>
	<web_url>http://jhbmi.ir/browse.php?a_code=A-10-304-1&amp;slc_lang=fa&amp;sid=1</web_url>


<author_list>
	<author>
	<first_name>Nader</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Alishan Karami</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>نادر</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>عالیشان کرمی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>nalishan@gmail.com</email>
	<code>10031947532846003692</code>
	<orcid>10031947532846003692</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Imam Reza International University</affiliation>
	<affiliation_fa>دانشجوی دکتری علم اطلاعات و دانش شناسی، دانشکده علوم انسانی، دانشگاه بین المللی امام رضا (ع)، مشهد، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Mohsen</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Haji Zeinolabedini</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>محسن</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>حاجی زین العابدینی</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>zabedini@gmail.com</email>
	<code>10031947532846003693</code>
	<orcid>10031947532846003693</orcid>
	<coreauthor>Yes
</coreauthor>
	<affiliation>Ph.D. in Knowledge and Information Science, Faculty of Letters and Human Sciences, Shahid Beheshti University, Tehran, Iran</affiliation>
	<affiliation_fa>دکترای علم اطلاعات و دانش شناسی، استادیار دانشکده علوم تربیتی و روانشناسی، دانشگاه شهید بهشتی، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Iraj</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Radad</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>ایرج</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>رداد</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>irajradad@yahoo.com</email>
	<code>10031947532846003694</code>
	<orcid>10031947532846003694</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Imam Reza International University</affiliation>
	<affiliation_fa>دکترای علم اطلاعات و دانش شناسی، استادیار دانشکده علوم انسانی، دانشگاه بین المللی امام رضا (ع)، مشهد، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


	<author>
	<first_name>Seyed Javad</first_name>
	<middle_name></middle_name>
	<last_name>Ghazi-Mirsaeid</last_name>
	<suffix></suffix>
	<first_name_fa>سید جواد</first_name_fa>
	<middle_name_fa></middle_name_fa>
	<last_name_fa>قاضی میرسعید</last_name_fa>
	<suffix_fa></suffix_fa>
	<email>jghazi37@gmail.com</email>
	<code>10031947532846003695</code>
	<orcid>10031947532846003695</orcid>
	<coreauthor>No</coreauthor>
	<affiliation>Tehran University of Medical Sciences</affiliation>
	<affiliation_fa>دکترای کتابداری و اطلاع‌رسانی، دانشیار دانشکده پیراپزشکی و عضو مرکز تحقیقات مدیریت اطلاعات سلامت، دانشگاه علوم پزشکی تهران، تهران، ایران</affiliation_fa>
	 </author>


</author_list>


	</article>
</articleset>
</journal>
