fa بررسی مسیرهای سیگنالی متابولیسمی در سلول‌های بنیادی سرطان گلیوبلاستوما به واسطه آنالیز‌های بیوانفورماتیک بیوانفورماتیک Bioinformatics پژوهشي اصیل Original Article <div style="text-align: justify;"><span style="line-height:2;"><span style="font-size:12px;"><span style="font-family:Tahoma;"><span style="color:#000000;"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><b><span lang="AR-SA">مقدمه: </span></b>&nbsp;<span lang="FA">گلیوبلاستوما یکی از سرطان‌های شایع مغزی بوده که نرخ مرگ و میر بالایی دارد. در این مطالعه با استفاده از آنالیز بیوانفورماتیک به بررسی و کاندید نمودن ژن‌های موجود در مسیرهای متابولیسمی سلول‌های بنیادی گلیوبلاستوما پرداخته شد.</span><span lang="AR-SA"><span style="color:#0d0d0d"></span></span></span></span><br> <span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><b><span lang="AR-SA">روش کار:</span></b> <span lang="AR-SA">در این مطالعه با مراجعه به پایگاه داده </span><span dir="LTR">GEO</span> <span lang="AR-SA">دیتاست مناسب برای آنالیز انتخاب گردید. این دیتاست شامل پروفایل بیان ژنی در سلول‌های بنیادی جدا شده از بیماران گلیوبلاستوما بود. کلاسترهای ژنی با بیان بالا و پایین دسته</span><span dir="LTR">‌</span><span lang="AR-SA">بندی شدند. برای ارزیابی دقیق‌تر داده از پایگاه های داده غنی همچون </span><span dir="LTR">Enrichr</span><span lang="AR-SA">، </span><span dir="LTR">STRING</span> <span lang="AR-SA">و </span><span dir="LTR">GEPIA</span> <span lang="AR-SA">استفاده شد. در نهایت ژن‌هایی کاندید و جدا ش</span><span lang="FA">دند</span><span lang="AR-SA">.</span><span dir="LTR"><span style="color:#0d0d0d"></span></span></span></span><br> <span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><b><span lang="AR-SA">یافته‌ها:</span></b> <span lang="AR-SA">1250 ژن در مسیر‌های بیوسنتز کلسترول، متابولیسم اینوزیتول تری فسفات، متابولیسم گرانیل گرانیل دی فسفات، بیوسنتز زیموسترول و متابولیسم فسفاتیدیل اینوزیتول بیان بالا داشته و 1030 ژن در مسیرهای کوندروییتین سولفات، درماتان سولفات، </span><span dir="LTR">N</span><span lang="AR-SA"> استیل گلوکوزآمین، مسیر گلیکولیز بیان پایین داشتند. پس از ارزیابی ارتباط بین شبکه‌های پروتئینی، ژن‌های با بیان بالا و ژن‌های با بیان پایین انتخاب شدند. تمامی این ژن‌‌ها در منحنی بقاء، در بازه حدود 20 ماه، زنده مانی بیماران کمتر از 10% مشاهده شد.</span></span></span><br> <span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><b><span lang="AR-SA">نتیجه‌گیری:</span></b> <span lang="AR-SA">نتایج این مطالعه نشان داد که ژن&nbsp; </span><span dir="LTR">DHCR7</span> <span lang="AR-SA">به طور معنی‌داری افزایش بیان داشته و ژن </span><span dir="LTR">ENO2</span> <span lang="AR-SA">نیز به طور معنی‌داری کاهش بیان داشته و بقیه ژن‌ها افزایش بیان و کاهش بیان نسبی داشتند.</span></span></span></span></span></span></span></div> <div style="text-align: justify;"><span style="line-height:2;"><span style="color:#000000;"><span style="font-size:12px;"><span style="font-family:Tahoma;"><b>Introduction:</b> Glioblastoma is one of the common brain cancers that has a high mortality rate. In this study, the genes present in the metabolic pathways of glioblastoma stem cells were examined and nominated using bioinformatics analysis.<br> <b>Method:</b> In this study, an appropriate dataset was selected for analysis by referring to GEO database. This dataset included gene expression profiles in stem cells isolated from glioblastoma patients. Gene clusters with high and low expression were categorized. Rich databases such as Enrichr, STRING, and GEPIA were used for more accurate data evaluation. Finally, candidate genes were isolated.<br> <b>Results:</b> 1250 genes were highly expressed in cholesterol biosynthesis, inositol triphosphate metabolism, geranyl diphosphate metabolism, zymosterol biosynthesis, and phosphatidylinositol metabolism, and 1030 genes were low in chondroitin sulfate, dermatan sulfate, N acetyl glucosamine, and glycolysis pathways. After evaluating the relationship between protein networks, genes with high and low expression were selected. All these genes were observed in the survival curve, in about 20 months. The survival rate of patients was less than 10%.<br> <b>Conclusion: </b>The results of this study showed that the DHCR7 gene had a significant increase in expression. However, the ENO2 gene had a significant decrease in expression. The rest of the genes had a relative increase and decrease in expression. </span></span></span></span></div> گلیوبلاستوما, سلول‌های بنیادی سرطانی, پروفایل بیان ژن و آنالیز بیوانفورماتیک Glioblastoma, Cancer Stem Cells, Gene Expression Profiles, Bioinformatics Analysis 131 148 http://jhbmi.ir/browse.php?a_code=A-10-762-3&slc_lang=fa&sid=1 Mehdi Nizamali مهدی نظاملی Mehdi.nezamly@gmail.com 10031947532846009935 10031947532846009935 No M.Sc. in Biology, Department of Biology, Islamshahr branch of Islamic Azad University, Islamshahr, Tehran, Iran کارشناس ارشد زیست شناسی، گروه زیست شناسی، واحد اسلامشهر دانشگاه آزاد اسلامی، اسلامشهر، تهران، ایران Mahnaz Mohammadi مهناز محمدی mh_mohamadi@yahoo.com 10031947532846009936 2162-3376-0002-0000 Yes Assistant Professor, Ph D. in Biology, Department of Biology, Islamshahr branch of Islamic Azad University, Islamshahr, Tehran, Iran دکتری زیست شناسی، استادیار گروه زیست شناسی، گروه زیست شناسی، واحد اسلامشهر دانشگاه آزاد اسلامی ، اسلامشهر، تهران، ایران Masoumeh Nezhad Ali Lampajani معصومه نژادعلی لفمجانی Ma_nejadali@yahoo.com 10031947532846009937 9807-3931-0002-0000 No Assistant Professor, Ph D. in Biology, Department of Biology, Islamshahr branch of Islamic Azad University, Islamshahr, Tehran, Iran دکتری زیست شناسی، استادیار گروه زیست شناسی، گروه زیست شناسی، واحد اسلامشهر دانشگاه آزاد اسلامی ، اسلامشهر، تهران، ایران